شناسایی، توالی یابی و بررسی ویژگی های ایمونولوژیک یک پروتئین سطحی اختصاصی acinetobacter baumannii با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی

acinetobacter baumannii یک باکتری گرم منفی، غیر متحرک و هوازی اجباری است که به عنوان پاتوژن بیمارستانی شناخته شده و غالباً مقاوم به انواع آنتی بیوتیک هاست. این باکتری همچنین به عنوان یک عامل مهم شیوع و مرگ ومیر در بیمارستان ها مخصوصاً در میان بیماران دارای نقص ایمنی شناسایی شده است. کنترل و درمان عفونت ناشی از آن به دلیل توانایی پاتوژن برای مقاومت به انواع آنتی بیوتیک ها و زنده ماندن در شرایط محیطی مختلف و استفاده از طیف وسیعی از منابع غذایی، سخت است. تشخیص اولیه عفونت ایجاد شده بوسیله a. baumannii استراتژی مهمی برای کنترل کردن عفونت بیمارستانی ناشی از این پاتوژن است. روش های رایج شناسایی این باکتری بوسیله روش های کشت معمول و تست های بیوشیمیایی است که بدست آوردن نتایج آن ها بین ? تا ? روز طول می کشد. بنابراین یک تست جدید، سریع، حساس، اختصاصی و اقتصادی که مدیریت سریع عفونت های a. baumannii را فراهم می کند، مورد نیاز است. ایجاد یک تست تشخیصی اختصاصی و حساس به یک بیومارکری نیاز دارد که واکنش تقاطعی با باکتری های دیگر نداشته و تنها برای a. baumannii اختصاصی باشد. براین اساس، هدف از این مطالعه شناسایی و توالی یابی یک پروتئین غشای خارجی kda 34.4 معرفی شده توسط islam et al. از بین پروتئین های غشای خارجی (omps) a. baumannii atcc 19606 است. در مطالعه حاضر ما از نرم افزارهای مختلف بیوانفورماتیکی برای غربالگری کل پروتئوم باکتری استفاده کردیم. غربالگری پروتئین ها با توجه به ویژگی هایی از جمله: وزن مولکولی، موقعیت یابی، توپولوژی، همولوژی، آنتی ژنیسیته و آلرژی زایی صورت گرفته است. در نهایت 201 پروتئین در وزن مولکولی بین kda 33-36 پیدا شد که در این میان 11 پروتئین به عنوان پروتئین غشای خارجی شناسایی شدند و در نهایت ? مورد از پروتئین ها از نظر مکانی کاندیدای مناسبی برای انتخاب بودند. براساس آنالیزهای انجام شده با blast و پیش بینی های آنتی ژنیسیته و دیگر بررسی های صورت گرفته تنها یکی از ? پروتئین به عنوان پروتئین آنتی ژن و اختصاصی a. baumannii شناخته شد.